Dari latar belakang pendidikan, Syekh Panji Gumilang setelah tamat Sekolah Rakyat, belajar membaca Alquran setahun.
Kemudian belajar di Pondok Pesantren Gontor Ponorogo, dan melanjutkan pendidikan tinggi di IAIN Ciputat.
Dikemudian hari menjadi ketua IKALUIN dua periode, kemudian membangun melalui Al Zaytun Indonesia.
Latar belakang pendidikan lainnya adalah sarjana di bidang Sosiologi di Universitas Terbuka (UT), kemudian melanjutkan program pendidikan magister di bidang agronomi.
BACA JUGA:Maung Presisi Tangkap Sejumlah Pemuda, Diduga Hendak Tawuran Konten di Kota Cirebon
Bidang agronomi ini, telah digelutinya berpuluh tahun demi mewujudkan kemandirian dan ketahanan pangan di Mahad Al Zaytun.
Selain itu, Syekh Panji Gumilang juga meraih gelar doktor honoris causa atau Doktor Kehormatan dari beberapa Universitas baik negeri ataupun swasta.
Bahkan dari universitas di luar negeri seperti Mindanao State University dan salah satu Lembaga Pendidikan Tinggi yang berbasis di Inggris, serta The University of Action Learning.
Sementara gelar profesor diperoleh dari Euclid University, bukan honorary professor tetapi professor penuh yang dalam sistem Pendidikan Amerika dan Eropa maju, dikenal sebagai Professor of Practice.